В начале Великой Отечественной войны, до призыва в РККА, был членом звена пожарной охраны ГЦБИЛ. В августе 1941 года участвовал в тушении пожара от зажигательных бомб крыши Библиотеки в Столешниковом переулке.

14 сентября 1941 года Свердловским РВК г.Москвы мобилизован в РККА. По данным портала "Память народа" в годы Великой Отечественной войны - красноармеец-автоматчик, воевал в 21 танковой бригаде, 234 стрелковом полку 179 стрелковой дивизии, в 259 стрелковом полку. В июле 1942 г. был ранен в бою у деревни Веревкино. Также в документах Центрального архива Министерства обороны есть упоминание о выбытии Н.А.Шкинева из воинской части 259 сп 16 декабря 1943 года.

Исходя из имеющихся в архиве Библиотеки документов, Н.А.Шкинев был жив в июне 1953 года.

Дальнейшую его судьбу установить не удалось.